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    如何保證siRNA能夠成功的轉染到細胞中?

    發(fā)布時間: 2021-12-10  點擊次數(shù): 4295次

    siRNA轉染和干擾效果不佳的問題。


    要保證RNA干擾的效果就必須保證siRNA能夠成功的轉染到細胞中去,那有時候會轉染不進去,原因可能有如下幾點:
    1、轉染方法:轉染siRNA濃度太低。FAM驗證轉染效率時siRNA(FAM)的量的終濃度是50-150nM都可以,需要根據細胞進行摸索。lipo2000的量和使用的siRNA量成比例的,一般用1:1的效果好一些。
    建議用24孔板摸索條件。siRNA所加的量及其濃度可以根據實驗自己調整,按照要求配成20uM的濃度,那1ul就是20pmol,在1ml細胞培養(yǎng)液中加1ul,那終濃度就是20nM,加2ul就是40nM,以此類推。24孔板摸濃度后,用6孔板時把轉染體系相應放大即可。
    實驗中需要注意細胞狀態(tài)要好,代數(shù)不要太大,細胞密度適中,50%左右(根據的細胞生長情況調節(jié)),鋪板時要鋪均勻,添加轉染復合物時要小心滴加。轉染時建議不要使用雙抗和血清,雙抗轉染時對細胞有毒性,會導致細胞狀態(tài)不好,血清會降低轉染效率。
    2、轉染試劑:轉染實驗前應根據實驗要求和細胞特性選擇適合的轉染試劑。每種轉染試劑都會提供一些已經成功轉染的細胞株列表和文獻,通過這些資料可選擇較為適合實驗設計的轉染試劑??赡芗毎麑ipo2000不是太敏感,建議更換其他的轉染試劑,例如ZETA LIFE Advanced系列轉染試劑,采用第三代多肽小分子材料,轉染的效率非常高,尤其轉siRNA效果非常好。
    3、細胞原因:
    a、轉染效率跟細胞狀態(tài)、細胞代數(shù)、細胞密度等有關,一般低的細胞代數(shù)(<50)能確保基因型不變。最這適合轉染的細胞是經過幾次傳代后達到指數(shù)生長期的細胞,細胞生長旺盛,最容易轉染。細胞培養(yǎng)在實驗室中保存數(shù)月和數(shù)年后會經歷突變,總染色體重組或基因調控變化等而演化。這會導致和轉染相關的細胞行為的變化。也就是說同一種系的細胞株,在各實驗室不同培養(yǎng)條件下,其生物學性狀發(fā)生不同程度的改變,導致其轉染特性也發(fā)生變化。因此,如果發(fā)現(xiàn)轉染效率降低,可以試著轉染新鮮培養(yǎng)的細胞以恢復最佳結果。
    b、有的細胞不太好轉染,比如懸浮、干細胞、原代細胞等,可查找相關文獻,看別人做這種細胞時用的什么方式。如果細胞不好轉,就要考慮換一種方式進行您的實驗了,比如說用病毒、電轉等。
    下圖是轉染FAM標記的siRNA后的前列腺癌細胞所拍的圖片,轉染進去的整個細胞是綠色的,可以清晰的看到細胞形態(tài),沒有轉染進去的就是綠色的小點兒。


    如果通過上邊的問題驗證到siRNA的確是可以轉染進細胞,但干擾效果又不理想的話那么可能的原因如下:


    1、轉染效率問題。如果少量siRNA進入細胞,作用于基因后,有時候細胞會有補償機制,表達量反而升高。建議在實驗前,先檢測一下轉染效率,觀察一下,轉染進去的整個細胞是綠的,沒有轉染進去的是一些綠色的小點粘附在細胞上,發(fā)的光是點狀的。建議多做幾個轉染梯度,找到最佳轉染條件。
    2、檢測時間點。建議轉染后24-48小時檢測RNA水平變化,48-72小時檢測蛋白水平變化。不同基因的半衰期是不同的,siRNA干擾是拋物線形的,多做幾個時間點有利于siRNA干擾效果的測定。
    3、推薦RT-PCR的引物應該設計在target位置的兩側,而不是同側。目前已經知道的siRNA介導的基因knockdown機制是RSIC先介導靶mRNA的切割,切割導致靶mRNA的降解,由于切割和降解可能具有不同的時間點,因此,設計于同側的PCR引物可能導致假陰性結果或knockdown效率的低估。
    4、RNA降解。建議-20保存,溶解后要最小量分裝,-20或者-80保存,3個月內用完,避免反復凍融或者4度保存。干粉保存最長最好不要超過6個月。
    5、基因問題。有的基因受細胞轉錄后調控,mRNA能敲除,但是蛋白水平敲除不下來的,如果這樣,建議換一種細胞看看。
    6、干擾靶點不合適。需重新設計siRNA。



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